Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pnmal2G3X9N3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms