Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nccrp1G3X9C2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nccrp1G3X9C2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms