Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc9a3G3X939 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms