Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim55G3X8Y1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms