Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Gm10378F6XQQ1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm10378F6XQQ1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm10378F6XQQ1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm10378F6XQQ1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm10378F6XQQ1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm10378F6XQQ1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm10378F6XQQ1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm10378F6XQQ1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm10378F6XQQ1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm10378F6XQQ1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm10378F6XQQ1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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