Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm340F6RGI3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm340F6RGI3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms