Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Urb2E9Q7L1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Urb2E9Q7L1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Urb2E9Q7L1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms