Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Zfp558E9Q1J0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zfp558E9Q1J0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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