Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdr1E9Q0B4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms