Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ryr1E9PZQ0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms