Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scaf11E9PZM7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Scaf11E9PZM7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms