Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rsph10bE9PYQ0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rsph10bE9PYQ0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms