Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc8E9PWG2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms