Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc17E9PVB5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc17E9PVB5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms