Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FgaE9PV24 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FgaE9PV24 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms