Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3bE9PUL3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms