Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm4871D3Z0W7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm4871D3Z0W7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms