Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd1D3YXK1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd1D3YXK1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms