Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim30cD3YVI9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms