Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cttnbp2B9EJA2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms