Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cspp1B2RX88 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms