Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Brpf1B2RRD7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Brpf1B2RRD7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms