Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC6

Cad, CAD protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CadB2RQC6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CadB2RQC6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms