Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed5B2RPU8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms