Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Uhrf1bp1B2KF50 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Uhrf1bp1B2KF50 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms