Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm2012B1B0R1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms