Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col4a6B1AVK5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a6B1AVK5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms