Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb1A2AQ07 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb1A2AQ07 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms