Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GabreA2AMW3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms