Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmpd1A2AKB4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmpd1A2AKB4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmpd1A2AKB4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmpd1A2AKB4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmpd1A2AKB4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmpd1A2AKB4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmpd1A2AKB4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmpd1A2AKB4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmpd1A2AKB4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Frmpd1A2AKB4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Frmpd1A2AKB4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Frmpd1A2AKB4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Frmpd1A2AKB4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Frmpd1A2AKB4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Frmpd1A2AKB4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Frmpd1A2AKB4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Frmpd1A2AKB4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms