Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ambra1A2AH22 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ambra1A2AH22 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms