Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l1A2A259 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkd2l1A2A259 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms