Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc173A0JLY1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc173A0JLY1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms