Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU3

Trdc, T cell receptor delta, constant region (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdcA0A0G2JEU3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TrdcA0A0G2JEU3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TrdcA0A0G2JEU3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TrdcA0A0G2JEU3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TrdcA0A0G2JEU3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TrdcA0A0G2JEU3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TrdcA0A0G2JEU3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrdcA0A0G2JEU3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrdcA0A0G2JEU3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrdcA0A0G2JEU3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrdcA0A0G2JEU3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrdcA0A0G2JEU3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrdcA0A0G2JEU3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrdcA0A0G2JEU3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrdcA0A0G2JEU3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TrdcA0A0G2JEU3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms