Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stub1Q9WUD1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Stub1Q9WUD1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stub1Q9WUD1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stub1Q9WUD1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stub1Q9WUD1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stub1Q9WUD1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stub1Q9WUD1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stub1Q9WUD1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stub1Q9WUD1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stub1Q9WUD1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stub1Q9WUD1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stub1Q9WUD1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stub1Q9WUD1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stub1Q9WUD1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stub1Q9WUD1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stub1Q9WUD1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stub1Q9WUD1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stub1Q9WUD1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stub1Q9WUD1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms