Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn8Q9QZ49 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn8Q9QZ49 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn8Q9QZ49 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn8Q9QZ49 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubxn8Q9QZ49 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubxn8Q9QZ49 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubxn8Q9QZ49 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn8Q9QZ49 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn8Q9QZ49 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn8Q9QZ49 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ubxn8Q9QZ49 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ubxn8Q9QZ49 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ubxn8Q9QZ49 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubxn8Q9QZ49 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ubxn8Q9QZ49 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms