Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fcf1Q9CTH6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fcf1Q9CTH6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fcf1Q9CTH6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fcf1Q9CTH6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fcf1Q9CTH6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fcf1Q9CTH6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fcf1Q9CTH6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fcf1Q9CTH6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fcf1Q9CTH6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fcf1Q9CTH6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms