Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI79

Ccdc40, Coiled-coil domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc40Q8BI79 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc40Q8BI79 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc40Q8BI79 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc40Q8BI79 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms