Protein–RNA interactions for Protein: Q811G0

Bbs9, Protein PTHB1, mousemouse

Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs9Q811G0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bbs9Q811G0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bbs9Q811G0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bbs9Q811G0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bbs9Q811G0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Bbs9Q811G0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bbs9Q811G0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bbs9Q811G0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms