Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Vps54Q5SPW0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vps54Q5SPW0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vps54Q5SPW0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vps54Q5SPW0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Vps54Q5SPW0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vps54Q5SPW0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Vps54Q5SPW0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps54Q5SPW0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1610.4 ms