Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrc4Q3UP24 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nlrc4Q3UP24 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrc4Q3UP24 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrc4Q3UP24 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms