Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smpdl3bP58242 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smpdl3bP58242 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpdl3bP58242 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpdl3bP58242 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms