Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TubP50586 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TubP50586 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TubP50586 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TubP50586 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TubP50586 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TubP50586 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TubP50586 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TubP50586 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TubP50586 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TubP50586 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TubP50586 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TubP50586 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TubP50586 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TubP50586 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TubP50586 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TubP50586 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TubP50586 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TubP50586 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TubP50586 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TubP50586 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TubP50586 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TubP50586 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TubP50586 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TubP50586 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TubP50586 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TubP50586 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TubP50586 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TubP50586 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TubP50586 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TubP50586 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TubP50586 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TubP50586 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TubP50586 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TubP50586 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TubP50586 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TubP50586 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TubP50586 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TubP50586 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TubP50586 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TubP50586 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TubP50586 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TubP50586 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TubP50586 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TubP50586 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TubP50586 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TubP50586 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TubP50586 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TubP50586 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TubP50586 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TubP50586 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TubP50586 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TubP50586 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TubP50586 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TubP50586 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TubP50586 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TubP50586 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TubP50586 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TubP50586 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TubP50586 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TubP50586 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TubP50586 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TubP50586 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TubP50586 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TubP50586 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TubP50586 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TubP50586 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TubP50586 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TubP50586 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TubP50586 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TubP50586 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TubP50586 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TubP50586 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TubP50586 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TubP50586 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TubP50586 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TubP50586 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TubP50586 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TubP50586 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TubP50586 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TubP50586 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TubP50586 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TubP50586 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TubP50586 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TubP50586 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TubP50586 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TubP50586 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TubP50586 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TubP50586 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TubP50586 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TubP50586 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TubP50586 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TubP50586 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TubP50586 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TubP50586 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TubP50586 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TubP50586 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TubP50586 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TubP50586 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TubP50586 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms