Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
F3P20352 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
F3P20352 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
F3P20352 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
F3P20352 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
F3P20352 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
F3P20352 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
F3P20352 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
F3P20352 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
F3P20352 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
F3P20352 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
F3P20352 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
F3P20352 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
F3P20352 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
F3P20352 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
F3P20352 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
F3P20352 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
F3P20352 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
F3P20352 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
F3P20352 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
F3P20352 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
F3P20352 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
F3P20352 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
F3P20352 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
F3P20352 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
F3P20352 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
F3P20352 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
F3P20352 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
F3P20352 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F3P20352 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F3P20352 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F3P20352 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F3P20352 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
F3P20352 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F3P20352 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F3P20352 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F3P20352 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
F3P20352 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F3P20352 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F3P20352 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
F3P20352 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F3P20352 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F3P20352 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
F3P20352 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F3P20352 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
F3P20352 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F3P20352 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F3P20352 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F3P20352 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F3P20352 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F3P20352 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F3P20352 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F3P20352 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F3P20352 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F3P20352 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F3P20352 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F3P20352 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F3P20352 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F3P20352 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F3P20352 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F3P20352 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F3P20352 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
F3P20352 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
F3P20352 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F3P20352 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F3P20352 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F3P20352 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F3P20352 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F3P20352 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F3P20352 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F3P20352 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F3P20352 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F3P20352 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F3P20352 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
F3P20352 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F3P20352 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F3P20352 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F3P20352 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F3P20352 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F3P20352 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
F3P20352 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F3P20352 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
F3P20352 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F3P20352 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F3P20352 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
F3P20352 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
F3P20352 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F3P20352 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F3P20352 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F3P20352 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F3P20352 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F3P20352 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
F3P20352 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F3P20352 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F3P20352 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F3P20352 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F3P20352 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
F3P20352 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F3P20352 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F3P20352 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms