Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kcna1P16388 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kcna1P16388 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Kcna1P16388 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Kcna1P16388 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kcna1P16388 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kcna1P16388 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcna1P16388 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcna1P16388 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcna1P16388 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcna1P16388 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcna1P16388 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Kcna1P16388 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kcna1P16388 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcna1P16388 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms