Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ly6c1P0CW02 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ly6c1P0CW02 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ly6c1P0CW02 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ly6c1P0CW02 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ly6c1P0CW02 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ly6c1P0CW02 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ly6c1P0CW02 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ly6c1P0CW02 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ly6c1P0CW02 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ly6c1P0CW02 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ly6c1P0CW02 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ly6c1P0CW02 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ly6c1P0CW02 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ly6c1P0CW02 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ly6c1P0CW02 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ly6c1P0CW02 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ly6c1P0CW02 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ly6c1P0CW02 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ly6c1P0CW02 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ly6c1P0CW02 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ly6c1P0CW02 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ly6c1P0CW02 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ly6c1P0CW02 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ly6c1P0CW02 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ly6c1P0CW02 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ly6c1P0CW02 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ly6c1P0CW02 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ly6c1P0CW02 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms