Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tk1P04184 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tk1P04184 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tk1P04184 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tk1P04184 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tk1P04184 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tk1P04184 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tk1P04184 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tk1P04184 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tk1P04184 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms