Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Apaf1O88879 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Apaf1O88879 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Apaf1O88879 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Apaf1O88879 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Apaf1O88879 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Apaf1O88879 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Apaf1O88879 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Apaf1O88879 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Apaf1O88879 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Apaf1O88879 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Apaf1O88879 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms