Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad6O35182 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smad6O35182 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smad6O35182 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smad6O35182 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad6O35182 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smad6O35182 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad6O35182 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smad6O35182 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad6O35182 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad6O35182 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad6O35182 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad6O35182 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad6O35182 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad6O35182 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Smad6O35182 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad6O35182 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad6O35182 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad6O35182 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad6O35182 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smad6O35182 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad6O35182 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smad6O35182 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad6O35182 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad6O35182 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad6O35182 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad6O35182 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms