Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbbp8nlA2ABX0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rbbp8nlA2ABX0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rbbp8nlA2ABX0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbbp8nlA2ABX0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rbbp8nlA2ABX0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms